PROTEÔMICA DO CÂNCER: ISOFORMAS DE SPLICING ALTERNATIVO COMO POTENCIAIS MARCADORES MOLECULARES DE TECIDOS TUMORAIS

Authors

  • L. C. Morais Gama A. C. Camargo Complexo Educacional Faculdades Metropolitanas Unidas
  • R. F. Ramalho A. C. Camargo

Keywords:

câncer, exon-skipping, marcadores, proteômica.

Abstract

Resultados recentes indicam que a espectrometria de massas (MS) é capaz de detectar proteí­nas que diferem daquelas descritas pela anotação referência do genoma humano (proteí­nas alternativas). Em trabalho anterior, usamos dados de MS e identificamos, para 19 genes, proteí­nas alternativas geradas pela tradução de transcritos contendo exon-skipping. O estudo do proteoma em linhagens celulares tumorais revelou um número de proteí­nas alternativas aproximadamente 10 vezes maior do que em tecidos normais. No presente trabalho buscamos em dados públicos de espectrometria de massa de adenocarcinoma de colon e colon normal pela presença de 14 isoformas geradas por splicing alternativo previamente detectadas em tecidos humanos normais. Assumindo uma taxa de falso-positivo menor do que 1%, observamos que variantes dos genes HNRNPAB (sem o exon 6) e FN1 (sem o exon 25) foram detectadas nas amostras de cólon tumoral, mas não em cólon normal e portanto representam potenciais marcadores de adenocarcinoma de cólon.

Author Biographies

L. C. Morais Gama, A. C. Camargo Complexo Educacional Faculdades Metropolitanas Unidas

A. C. Camargo
Centro Internacional de Pesquisa (CIPE), Rua Taguá, 440, Liberdade, 01508-010

R. F. Ramalho, A. C. Camargo

A. C. Camargo
Centro Internacional de Pesquisa (CIPE), Rua Taguá, 440, Liberdade, 01508-010

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Published

2016-12-28

Issue

Section

Resumo Expandido